Toute les interventions de l'établissement sont délibérées et arrêtées au sein de son conseil d'administration. Celui-ci est composé de neuf représentants des collectivités provinciales et de la Nouvelle-Calédonie :

• un représentant de le Province des Iles Loyauté,
• trois représentants de la Province Nord,
• quatre représentants de la Province Sud,
• un représentant de la Nouvelle-Calédonie.

Il est présidé par un représentant des Assemblées de Provinces, élu par le conseil en son sein, pour une durée d'un an. Des membres consultatifs apportent un avis à la définition des actions de l'ERPA : un représentant des producteurs par province, le directeur du développement de chaque province, l'Exécutif de la Nouvelle-Calédonie, le payeur de la Nouvelle-Calédonie et le directeur de l'établissement.

Administrateurs ayant voix délibérative :

• Président : Philippe MICHEL, élu représentant de la Province Sud.
• Vice-Président : Nicole ANDREA-SONG, élue représentante de la Provine Sud.
• Gérard POADJA, représentant de la Nouvelle-Calédonie.
• Ghislaine ARLIE,  élue représentant de la Povince Sud.
• Pascal VITTORI, élu représentant de la Porvince Sud.
• Léontine PONGA, élue représentante de la Province Nord.
• Joseph GOROMIDO, élu représentant de la Province Nord.
• Guigui DOUNEHOTE, élu représentant de la Province Nord.
• Mathias WANEUX, élu représentant de la Province des Iles Loyauté.